2009年元旦刚过，学校召开了更名后的第一次党代会。会议选在了一个“瑞雪兆丰年”的时候，选在了一个新的年度刚刚开始的时候。而随后这一年成为全校贯彻党代会精神的重要一年。
大会听取、审议并通过了陈海英所做的《全面加强党的建设，推动学校事业又好又快发展，为把我校建成一流教学研究型中医药大学而奋斗》的工作报告，大会提出了加强内涵建设，把我校建设成为一流中医药大学的目标。选举产生了由（按姓氏笔画为序）门瑞雪、王之虹、王中男、王富春、曲晓波、刘宏岩、孙星、李磊、杨茂有、宋柏林、张大方、张晓明、陈心智、陈海英、周立、周进、郑力夫、郝东明、胡树毅、姜彤伟、徐国成等21人组成的第一届党委会和由（按姓氏笔画为序）王延博、刘兴山、周进、周艳秋、郑毅、赵丹、都晓春等7名同志组成的纪律检查委员会。大会选举陈海英、王之虹、周立、曲晓波、刘宏岩、周进、姜彤伟、宋柏林、孙星为党委常委，选举陈海英同志为党委书记、周立同志为副书记、周进同志为纪委书记。
一年来，全校党员和师生员工按照党代会提出的目标，团结一心共同奋斗，各项事业取得了新的成绩。
按照中央、省委的部署，我校用半年的时间开展了深入学习实践科学发展观活动。此次学习实践活动分为学习调研、分析检查、整改落实三个阶段。学习实践活动中，我校党委高度重视，坚持突出“党员干部受教育、科学发展上水平、师生员工得实惠”的总体要求，坚持突出“科学发展、强化内涵、突出特色、争创一流”的主题；坚持突出“保发展、保民生、保稳定”的首要任务，突出领导班子和党员领导干部这一重点，精心组织，扎实推进、取得实效。通过活动，党员领导干部思想进一步解放，在科学发展方面有了新共识；将落实科学发展观与学校事业发展有机结合，使学校各方面的工作有了新成效；通过此次活动，解决了群众迫切需要解决的实际问题。
学校第一次党代会提出“依法治校”的方略，而教代会制度正是学校走向民主管理监督、依法治校的重要制度。4月25日，第七次教职工代表大会暨第九次工会会员代表大会隆重召开。校长王之虹向大会做了《科学发展、强化内涵、突出特色、争创一流，为把我校早日建设成一流教学研究型中医药大学而奋斗》的工作报告，就一年来的工作提交教代会代表审议。会议还对即将要进行的内部管理体制改革方案进行了审议和表决。
走过学校的宣传栏，是首都北京国庆阅兵的图片展，看着这些图片，让我们想起了学校师生喜迎国庆活动的情景。
在国庆即将到来的一段时间里，全校开展了一系列的活动与伟大的祖国共同欢庆六十华诞。如：“我爱我的祖国图片展”、教职工球类比赛、国庆征文、摄影大赛、国庆寄语、迎国庆升旗仪式，等等。这些渗透着师生们喜悦和赞美的活动向我们昭示着他们浓烈的爱国热情和备受鼓舞的奋斗信心。
2009年8月5日，校长王之虹从省委常委、市委书记高广滨手中接过“文明单位”的奖牌，标志着我校在精神文明建设方面又取得了新的突破。与此同时，我校第一附属医院获得了长春市“精神文明建设工作先进单位”的称号。
长春市“文明单位”的获得是多年来学校事业跨越式发展和精神文明创建的结果。我校获得市级“文明单位”称号后，根据有关奖励规定，为全校教职工奖励了一个月的工资。
今年5月，我校新一轮内部管理体制改革和干部竞聘工作全面铺开。这次内改和干部聘任工作是我校第一次党代会召开之后，在全校上下开展深入学习实践科学发展观活动大背景下进行的。本次改革，对学校内设机构进行了局部调整，组织了干部竞争上岗，共有42名正处级干部（含4名正处级岗位、副处级主持工作同志）、39名副处级干部、66名科级干部竞聘上岗。本次竞聘中，正处级干部任命实行了党委全委会议审议、票决通过的程序，新提拔副处级以上干部还进行了理论测试环节。12月，新的教职工津贴分配方案下发执行，全校职工工资结构发生了变化，职工收入有了大幅度提高。
吉林省高等教育教学成果奖是吉林省政府将，每四年评一次。在本次评选出的302项省级优秀教学成果获奖项目中我校共获得一等奖1项，二等奖1项，三等奖3项。除了优秀教学成果外，高等教育“质量工程”项目中，《中药学“两段双向型”人才培养模式创新实验区》入选2009年度人才培养模式创新实验区，将在2010年获资助经费50万元。
4月，吉林省人参科学研究院经省政府批准落户我校，科技大厦5楼有了新主人。这时我校科研领域的新突破。吉林省人参科学研究院将实行省校共建，全国政协常委、省科协主席、原副省长刘淑莹担任吉林省人参科学研究院院长。
2009年学校科技重大项目上也有了新的突破。仅就国家自然科学基金项目方面，在申报数、形式审查通过率、中标数上创历史新高，今年共中标5项，极大地鼓舞了广大教师的士气，使广大教师坚定了科研工作的信心，同时也激发了我校追求更高科研工作水平的勇气。
今年9月，我校中医学、中药学学科被批准设立博士后科研流动站，开展博士后工作。这是我校继新校区建成使用、获得博士学位授权、成为省属重点高校、更名为中医药大学等标志性成就后又一具有里程碑意义的成就。
博士后科研流动站，是指在高等学校或科研院所的某个一级学科范围内，经批准设立的可以招收博士后研究人员组织。我校中医学、中药学获批博士后站点，充分体现了我校这两个学科具有较强的科研实力和较高的学术水平，能承担高水平的研究项目，也标志着我校这两个学科的科研工作处于国内前列。
经过严格遴选，国家中医药管理局公布了323个新一轮重点学科建设点，我校9个学科名列其中。这9个学科分别是内经学、中医心病学、中医肺病学、中医脑病学、中医骨伤科学、针灸学、推拿学、药用动物学、中药药理学。这9个学科将得到国家经费支持，建设周期为5年。
中医药重点学科是整个中医学科群的龙头。中医药重点学科建设关乎中医药事业全面协调可持续发展，是统领中医药各项业务建设的基础和平台，也是培养造就高素质创新人才和名医的重要途径。国际中医药管理局进行新一轮中医药重点学科评选是落实《国务院关于扶持和促进中医药事业发展的若干意见》的具体举措。本次入选的重点学科建设点代表了目前全国中医药学科建设的水平。
对于今年升入大学的2009级新生来说，对大学的印象除了军训、开学典礼等以外，还有紧张的气氛和封闭的校门。的确，随着“甲流”疫情的蔓延，学校于5月初就开始部署落实防控甲型H1N1流感疫情的工作。9月，新学期开始后，根据疫情变化加强了校园管理，建立了报告制度、值班制度等制度，发放了预防的中药制剂等。至今为止，我校没有发生一例“甲流”疫情。但“甲流”防控任务依旧艰巨。
